本实用新型公开一种调温机构以及单细胞文库制备设备，所述调温机构用于安装至进出仓，所述调温机构包括制冷片以及控制装置，所述制冷片用以与微流体芯片板的多个芯片进行换热连接，所述制冷片形成多个调温区域；所述控制装置与所述制冷片电性连接，以可选择地接通所述制冷片的任意所述调温区域，以对相应的所述芯片进行制冷，其中多个所述芯片中的部分所述芯片进行制备过程，从而能够通过所述控制装置接通对应部分所述芯片的调温区域，以对应进行制备的部分所述芯片进行调温，避免采用整片制冷片进行制冷，如此，操作简单，能够精准制冷并且节约能源。