本发明公开了一种包埋抗癌药物的微胶囊的制备方法。该方法采用内含聚电解质的胶体微粒为模板，通过层层静电自组装方法将具有相反电荷的聚电解质组装到胶体微粒表面，将胶体微粒溶解或分解，得到内含聚电解质的聚合物中空微胶囊。微胶囊的囊壁微结构和厚度可在纳米尺度精确控制，内含的聚电解质可以与药物相互作用，从而将药物包埋到微胶囊内。包埋的药物释放速率可控。通过在微胶囊表面引入接枝有聚乙二醇的聚电解质，以提高微胶囊的生物相容性。本发明所提供的药物包埋工艺过程简单可行，重复性好，药物释放速率可控，适用于多种水溶性抗癌药物的包埋和可控释放，具有良好的应用前景。