本发明涉及磁共振影像后处理领域，一种基于海马中轴的群组形状分析方法，对脑的磁共振数据进行处理。在采集到磁共振影像数据并经过必要的预处理后，由专家手工分割海马，用marching cube方法提取位于海马表面点的坐标，然后对海马建立参数化曲面模型，求出海马的中轴，利用对应的纬线圈面积对中轴进行配准，以获取更好的组织对应性，最后，利用海马表面网格点到中轴的距离为测度，用排列测试方法进行显著性统计分析。该方法计算过程快速，在普通的微机上即可完成。该方法可广泛应用于海马磁共振影像的基础研究与临床辅助诊断中。