本发明涉及了纳米，生物技术及微全分析领域，提供了一种可用作微流控芯片手性固定相的制备方法。随着微全分析系统的发展，基于微流芯片的手性分离崭露头角。但是，芯片材料往往会由于其不稳定的电渗流而导致分离效果不佳及整体性能不稳定。本发明报道了采用功能化碳纳米管键合蛋白作为芯片手性分离固定相的制备方法。所得固定相能有效地用于修饰过的芯片进行手性分离异构体。该方法使得手性分离能借助于芯片分离通道内的固定相得以实现。用本发明所述方法合成的蛋白固定相简单，成功率极高，所固定的蛋白量大，活性高，稳定性好。