一种计算机扩充卡插入检测系统，包括一主板及一扩充卡，该主板包括一用于插接该扩充卡的插槽，该插槽包括一第一检测针脚及一第二检测针脚，该第一检测针脚接地，该第二检测针脚连接一检测电源，该主板还包括一控制器，该控制器的一控制端连接该检测电源，该扩充卡包括一分别对应该第一检测针脚与该第二检测针脚且相互连接的第一扩充针脚及第二扩充针脚，当该扩充卡未插入该插槽时，该控制器的控制端接收到该检测电源的高电平信号，该控制器断开该插槽的一功能连接，当该扩充卡插入该插槽时，该控制器接地，该控制器导通对该插槽的功能连接。本实用新型计算机扩充卡插入检测系统可检测是否扩充卡被插入，以便进行相应的扩充卡功能控制。