本发明涉及一种估计测量机不确定性的方法，包括：基于估计的测量机的精度描述估计长度测量的不确定性；从估计的不确定性计算方差，并且通过一定的函数来近似协方差，以导出协方差矩阵或相关矩阵；从对上一步骤中导出的协方差矩阵的特征值分解中导出特征值和特征向量；通过产生正态随机数作为耦合在上一步骤中导出的各特征向量的系数来产生测量机的伪测量值并综合所有特征向量，该正态随机数具有期望值0并且方差等于对应于特征向量的特征值；以及通过对在前面步骤中获得的伪测量值进行统计处理来估计测量机的不确定性。