本发明属于抗干扰装置技术领域，公开了一种雷达有源干扰的识别方法及系统，所述雷达有源干扰的识别方法对接收到的有源干扰进行变分模态分解，得到不同的模态分量；计算每个固有模态分量相应的矩形积分双谱，组合成特征参量；通过随机森林分类器实现雷达有源干扰方式的识别。本发明可以有效实现较低信噪比环境下常见的六种雷达有源干扰(射频噪声干扰、噪声调频干扰、噪声调幅干扰、噪声调相干扰、距离假目标、速度目标，转发式密集假目标)的分类，且不需要进行信干比估计等预处理。