本发明属于网络安全技术领域，特别涉及一种基于深度神经网络的安全态势智能预测方法、装置及系统，该方法包含：以自动编码器为基本单元，结合误差反向传播BP神经网络，构建用于网络安全态势无监督训练学习的深度自编码网络模型；结合专家知识和层次评估深度自编码网络模型依次进行无监督逐层预训练和有监督模型参数微调，得到训练后的网络模型；基于训练后的网络模型，对目标网络安全态势进行预测。本发明通过应用深度自编码器作为基本结构，采用无监督逐层算法进行预训练，采用有监督算法进行参数微调，解决了对网络安全数据标签的依赖性问题，实现安全态势的自动化监测和智能预警，提高态势预测的精度和时效。