本发明公开了一种多层级任务可靠性分配方法及系统，包括基于目标产品和分析目标获取所需的分配层级模型，所述分配层级模型中包括若干个顺次关联的单层模型，各顺次关联的单层模型中的组成单元的规模逐次减小，且所述单层模型中的各参数均为目标产品的可靠性指标；基于所述分配层级模型以及分析目标，获得各单层模型中各组成单元的可靠性分配系数；对各单层模型中各组成单元的可靠性分配系数进行优化，获得优化过的可靠性分配系数，完成多层级任务可靠性的分配。本发明核心分配系数确定方法从故障维修数据出发，依据单元故障发生特点，而不延续相互间的故障发生关系，避免了传统技术方案主观能动性和可实施性差的缺点。