本实用新型公开了一种代谢组学细胞快速取样淬灭仪，包括外筒，所述外筒的顶部可拆卸连接有密封盖，所述外筒的中部转动连接有旋转杆，所述旋转杆的侧面均匀分布有多个旋转盘，多个所述旋转盘与旋转杆固定连接，所述外筒的一侧连通有与多个旋转盘相对应进料管，多个所述进料管远离旋转盘的一端均与主管道连通，所述主管道的顶部设有进料口，所述密封盖的顶部设有清洗液进口，所述外筒的另一侧设有冷冻刮刀。本实用新型通过设置多个旋转盘进行处理细胞，在离心的同时处理多组细胞，从而提高了细胞淬灭的处理量，将冷冻刮刀与冷冻源垂直设置，且位于旋转盘的下方，减小了冷冻距离，降低了冷冻时间，从而提高淬灭的效率。