本实用新型提供一种石蜡切片蛋白质组学样本采集装置。所述石蜡切片蛋白质组学样本采集装置，包括采集箱，所述采集箱内壁一侧的顶部滑动连接有支撑板，所述支撑板的另一侧贯穿采集箱且延伸至采集箱的外部，所述支撑板的顶部固定连接有搅碎箱，所述搅碎箱的底部连通有漏斗，所述采集箱内壁的底部设置有保存箱，所述采集箱内壁的两侧之间固定连接有固定板，所述漏斗的底部依次贯穿支撑板、固定板和保存箱且延伸至保存箱的内部，所述保存箱顶部的一侧固定连接有冷凝器。本实用新型提供的石蜡切片蛋白质组学样本采集装置将样本放入低温状态的化学药液中，终止细胞的一切代谢过程、防止细胞自溶或组织变化，从而最大限度的保持其活体时的结构。