本实用新型公开了一种应用于环境检测的微生物高压灭菌装置，包括外桶，和同轴设置于外桶中的内桶，且外桶顶部设置密封外盖，密封外盖上设有排放阀口，外桶底部设置输入阀口，所述内桶顶部设置排放接口，底部设置灭菌接口，排放阀口通过连接软管连接排放接口，输入阀口通过连接软管连接灭菌接口。本实用新型结构简单，操作方便，外桶和内桶均设置有密封盖体，可进行独立灭菌，能够根据灭菌物料多少而进行调整，灭菌物料多时可放置于外桶或内桶中，灭菌物料少时则放置于外桶或内桶中进行灭菌，减少热量浪费，提高穿透灭菌效果；能有效延长热量的运动路径和时间，提高高压灭菌的质量和效果，节约能源，降低灭菌成本，利于推广使用。