本发明提供了一种超高次谐波测量方法及系统，该方法包括：当电能质量监测系统核心模块将采样数据环形缓存区的当前写环形缓存区指针切换到下一个采样数据环形缓存区之后，通道切换模块切换到下一个需要分析的采样通道；在信号通过通道切换模块后，带通滤波器滤除待分析超高次谐波频段信号之外的信号，并将待分析超高次谐波频段信号输入单通道高速AD；电能质量监测系统核心模块触发单通道高速AD进行采样并读取采样数据，然后将采样数据存入采样数据环形缓存区，由电能质量监测系统核心模块对采样数据进行分析和统计，得到超高次谐波的频谱和时频图。相对于现有技术，本发明降低超高次谐波测量成本，提升系统的性价比和稳定性。