本发明涉及微生物发酵技术领域，具体地涉及一种纳豆菌发酵菜用大豆等外品产纳豆激酶的方法，包括：将配制好的纳豆菌菌液按2％接种到经挑选、清洗、蒸熟灭菌后的菜用大豆等外品中，在37℃恒温培养箱中发酵36小时，后熟18小时，盐溶离心得初提取液，硫酸铵盐析初步纯化得粗酶液，再用DEAE离子交换柱层析进一步纯化。本发明的目的是为发酵产纳豆激酶提供一种新的思路，以及为公司等外品的处理问题提供解决方案。最佳发酵工艺下生产的纳豆激酶活力可达到2326.60IU/g；经SDS‑PAGE电泳试验验证，所提取的纳豆激酶的分子质量为25～35kDa之间，回收率和纯化倍数分别为4.9％和11.2倍；本发明为纳豆激酶的生产及后续的体内试验提供了理论基础。