本发明提供一种使用螺杆和旋转导向工具组合系统的钻井方法，其包括：根据井眼的狗腿度，将井眼分为低狗腿井段、中狗腿井段和高狗腿井段，低狗腿井段的狗腿度小于中狗腿井段的狗腿度，中狗腿井段的狗腿度小于高狗腿井段的狗腿度；使用具有螺杆和旋转导向工具组合系统的钻具钻井，在钻进过程中，当螺杆处于低狗腿井段时使用第一顶驱转速，当螺杆处于中狗腿井段时使用第二顶驱转速，当螺杆处于高狗腿井段时使用第三顶驱转速，第一顶驱转速大于第二顶驱转速，第二顶驱转速大于第三顶驱转速。本发明通过提高钻进时的顶驱转速，能进一步提高机械钻速，并改善钻进时的井眼清洁，降低岩屑床高度，降低发生岩屑雪崩、砂桥卡钻等井下事故的风险。