本发明公开了一种城市拥堵区域路网双层边界控制方法，采用出租车GPS数据和实地勘测数据，建立了路网微观仿真模型，同时构建路网宏观基本图(MFD)，在此基础上首先根据包含控制延误的路网边界控制方法(第一层控制)确定路网预期进入总量，随后将各个控制交叉口按一定的方式扩展为虚拟子区路网，以降低路网密度分布方差为控制目标，考虑因路网进入总量控制产生的排队溢出管控，开发了路网进入总量分配方法(第二层控制)。相比常用边界控制方法，控制总量分配优化控制方法稳定、有效地提高了路网表现，避免了路网因控制产生的排队溢出，具有实际工程应用价值。