本发明提出一种梯级水库群全生态要素精细调度控制方法与系统，本发明在水库水位值约束下随机初始化种群，得到包含多个个体的初始种群；计算当前种群中个体适应度值，并更新种群全局最优位置和个体历史最优位置；引入个体历史最优位置和精英个体集合中的随机个体位置增加种群多样性，有效避免个体“早熟收敛”；引入精细化搜索策略，有效提升了种群收敛精度；通过迭代计算对种群中所有个体位置进行更新直至达到种群最大迭代次数；输出当前种群全局最优位置作为梯级水电站最终调度过程。本发明与经典智能优化方法相比鲁棒性高，能够有效减少整个梯级水库生态缺水，从而达到保护流域生态的目的；同时，本发明原理简单，求解精度高。