本发明公开了共振模拟子群优化方法，包括以下步骤：对共振核素进行分类；建立共振能群，并将共振能群统一为合并能群；构建中子输运方程；独立获取每个合并能群代表核素的等效宏观截面和源项信息；获取合并能群代表核素的子群通量；获取合并能群的子群逃脱截面；获取等效微观本底截面；获取等效吸收截面和等效生成截面；进行反应堆组件多共振核素共振模拟。本发明还公开了用于反应堆组件多共振核素共振模拟子群优化系统。本发明用于反应堆组件多共振核素共振模拟子群优化方法及系统，在不影响精度的前提下，对问题中的共振核素按类划分，对同一类的共振核素，只对其代表核素进行子群通量求解，减少了特征线方法计算时间，从而提高计算效率。