本发明提供一种基于人机交互的反应行为的分析方法及系统。该方法包括：接收被试观看刺激材料过程中对感兴趣内容做出的选择反应，得到反应数据并记录；接收各兴趣区标记信息；接收在显示参数选项内选择的参数；回放刺激材料，由兴趣区选项控制以选定兴趣区显示方式在材料中显示选择的兴趣区，并由参数控制显示选择的数据并在选择多个被试数据情况下以不同方式显示数据，由参数控制在回放材料中数据统计显示方式；在方式为热点图且显示所有数据情况下，统计显示同一兴趣区内总反应次数；在方式为轨迹图情况下，统计兴趣区流转序列；根据各兴趣区的总反应次数和流转序列进行分析。通过上述方案，能解决无眼动设备的情况下，对兴趣区的分析问题。