一种生物粒子定位感测方法包括：提供定义有多个检测区域的载盘；加入生物粒子样品至载盘中；生物粒子样品包括具有生物标记的第一生物粒子，且与相对应的标签交互作用；提供激发能量，使第一生物粒子上的标签放射出放射能量；移动第一感测器分别至检测区域，且接收到放射能量后，将接收到放射能量的检测区域定义为活性检测区域，并将活性检测区域的位置信息传送至处理模块；根据位置信息，移动第二感测器至检测区域，检测第一生物粒子在活性检测区域中的准确位置，且将准确位置传送至处理模块。一种生物粒子定位感测系统亦在此提供。通过上述方法及系统，可快速侦测特定的生物粒子，以提升检测效率。