一种生物粒子定位感测系统包括载盘、激发装置、第一感测器及第二感测器；载盘定义有检测区域，且生物粒子样品设置于载盘中；生物粒子包括具有生物标记的第一生物粒子；激发装置朝向载盘提供激发能量，使第一生物粒子上的标签放射出放射能量；第一感测器可相对于载盘移动，且分别移动至检测区域；当第一感测器接收到放射能量后，将接收到放射能量的所述检测区域定义为活性检测区域，并将活性检测区域的位置信息传送至处理模块；第二感测器移动至活性检测区域，检测第一生物粒子的准确位置，且将准确位置传送至处理模块。通过上述系统，可快速侦测特定的生物粒子，以提升检测效率。