一种物流智能码垛流水线系统，涉及物流机器人技术领域，包括底板、顶板、支撑箱体，顶板上表面形成码垛工作区和盒体料台，码垛工作区设有机器人、盒体轨道、盒体定位装置，盒体轨道的前端设有码垛井，物料盒体通过设置在盒体料台上的补料导轨输送至盒体轨道，在盒体轨道的后端设有盒体推送装置，底板的下表面设有带有刹车装置的万向轮。码垛工作区的码垛工作包括在物料盒体内对物流包装箱码垛、以及将多个已经装满物流包装箱的物料盒体在码垛井处码垛。本发明不但可以实现物料盒体内的物流包装箱的码垛，且可实现多个物料盒体之间的码垛，通过自动化设计形成流水线作业，极大地减少了码垛工序，提高了工作效率。