本发明属于中兽药技术领域，具体涉及一种用于提高鱼类生长性能的中草药微生态制剂的制备方法。该中草药微生态制剂的制备方法包括以下步骤：将中药饮片组合物粉碎、灭菌后，得到中药颗粒，将中药颗粒与复合菌种混合并进行厌氧发酵；所述复合菌种由植物乳杆菌和屎肠球菌组成。利用本发明的方法制备的中草药微生态制剂，中草药成分能提高鱼体免疫力以及对饲料的消化吸收功能；中草药通过植物乳杆菌和屎肠球菌组成的复合益生菌发酵后，药物成分更易吸收，而且益生菌及其代谢产物进一步强化了促消化、抑菌、改善水体环境等功效，最终达到改善养殖环境、提高鱼体抗病力及保障鱼体健康快速生长的目的。