本发明涉及一种甘草抗炎有效部位的制备方法及其应用，该方法将甘草根茎自然干燥，机械粉碎，并过筛分离杂质，石油醚脱脂，无水乙醇脱色素,自然风干后用热水提取，离心，浓缩，无水乙醇沉淀，再离心，将多糖沉淀物用水溶解进行脱蛋白，透析，真空冷冻干燥，得水溶性甘草多糖，经离子交换树脂和葡聚糖凝胶色谱柱纯化得到甘草多糖有效部位；该多糖有效部位总糖含量达到94.87%，糖醛酸含量为8.76%，蛋白质含量为3.14%。通过本发明所述方法得到的甘草多糖有效部位纯度高，活性较广泛；经验证具有抗炎、降糖与益生元（促进益生菌生长）作用。并针对甘草多糖的有效部位进行了理化性质分析和生物活性评价，可为甘草多糖在功能性食药、药品和化妆品中的应用开发提供参考。