本实用新型公开了一种基于微反射镜阵列的激光通信系统的光轴配准装置，涉及激光通信系统的光轴配准装置技术领域，所述激光通信系统包括激光发射通道和激光接收通道；所述光轴配准装置包括水平光管和微反射镜阵列，所述微反射镜阵列可设置在所述水平光管的焦面位置处，当所述微反射镜阵列设置在所述水平光管的焦面位置处，且所述激光发射通道发出的光通过水平光管中的主镜和次镜照射到所述微反射镜阵列上时，所述微反射镜阵列用于通过角度旋转对其反射光的角度进行调节，以对所述激光通信系统的光轴进行配准。采用本实用新型的光轴配准装置操作简便，可以大幅提高装调精度，缩短装调时间，提高装调效率。