本实用新型提供了一种摩托车发动机密封结构，包括气缸盖和罩设于其上的气缸盖罩，气缸盖的内腔设置有链条室和架撑凸轮轴的凸轮轴支架；气缸盖的外壁板上开设有由其上表面向下沉，与凸轮轴支架上的凸轮轴孔进行加工配合的加工沉槽，加工沉槽与气缸盖的上表面之间平滑过渡，凸轮轴孔的加工型面落于加工沉槽的宽度范围内；气缸盖罩上伸出有与加工沉槽盖装配合的盖装凸台。加工凹槽与气缸盖上表面仅需要保证其宽度方向两端的两个平滑过渡位置，对应气缸盖罩上伸出盖装凸台，通过对加工沉槽的平滑过渡位置的角度控制，避免锐角结构，密封垫无需设置支架进行定型，避免密封结构受力不均，降低加工难度，提高密封性能。本实用新型还提供了一种摩托车。