本实用新型公开了一种治理海洋赤潮生物排泄物的清理装置，涉及到海洋治理设备技术领域，包括船体和固定块，其中船体顶端一侧固定设置有固定块，固定块中部贯穿开设有通槽，通槽内部活动设置有转板，且转板的一侧延伸至船体底部一侧，转板位于通槽内部的一侧固定贯穿设置有转轴，固定块内部开设有空腔，且空腔位于通槽背部，空腔背面内壁中部固定设置有驱动电机，转轴的一端插入通槽正面内壁中部。本实用新型通过滤网过滤一段时间的排泄物之后，通过驱动电机带动转轴转动，转轴带动转板反转至垃圾箱顶部，将滤网内部的排泄物清理到垃圾箱内部，有利于方便及时清理滤网内部排泄物，从而防止滤网堵塞。