本实用新型公开了一种治理海洋赤潮生物排泄物的清理装置，包括清理仓：所述清理仓一端设置有水泵，且水泵上连接有进水管，且进水管的两端分别延伸至海水和清理仓内，所述清理仓的内壁设置有隔板，且隔板的一侧设置有斜滤板，且斜滤板的底部设置有排污管，所述清理仓且位于斜滤板的下方设置有一对斜滤板喷水冲洗的反冲组件，所述清理仓的另一端设置有出水管。本实用新型中，该清理装置采用反冲组件的反冲洗作用，可以将排泄物清理后干净的海水抽出并作用在斜滤板上，对斜滤板上残留的排泄物颗粒进行循环冲洗效果，防止斜滤板发生堵塞的现象，同时也避免了斜滤板先拆装后清洗带来的不便，实现了斜滤板连续不间断的使用效果。