本实用新型公开了一种具有防护结构的无人控制飞行器控制器，包括固定基座，所述固定基座侧壁上固定连接有安装块，所述固定基座上端开设有凹槽，所述凹槽内设置有壳体，所述壳体内固定安装有控制器本体，所述凹槽内设置有用于对壳体进行缓冲减震防护的缓冲机构，所述壳体内设置有用于对壳体内的控制器本体进行冷却散热防护的散热机构，本实用新型设置有缓冲机构，利用弹簧和弹片对缓冲板进行缓冲减震，从而对壳体内的控制器本体进行缓冲减震防护，防止控制器本体由于震动而损坏，保证控制器的正常使用，本实用新型还设置有散热机构，利用风扇和雾化喷头对散热板进行散热，在热传递的作用下，对壳体内部的控制器本体进行冷却散热保护。