本申请公开了一种微生物发酵水浴装置，包括壳体、加热管、陶瓷导热板、顶盖、嵌合槽、嵌合块、竖杆、定位孔、活动套、第一固定螺母、第一螺栓、连杆、导向孔、固定套、连接套、固定螺丝、支撑脚、第二固定螺母和第二螺栓。本申请有益之处在于整个水浴装置用于微生物发酵时的水浴加热，通过固定套为微生物盛装的容器提供安装的位置，通过多个第二螺栓进行容器外壁的压紧，实现夹持限位，通过第二螺栓在第二固定螺母中，螺纹拧进的程度，在一定范围内适用于不同大小容器的夹持，使用方便，同时整体具有升降的功能，可进行容器在水浴装置中高度的调节，满足不同的需求，从而满足不同高度容器在内部的水浴。