本公开提供一种多叶法拉第筒、多叶法拉第筒测量系统及其应用。该多叶法拉第筒适用于大气环境测量，其包括多个交替排列的导体和绝缘体，导体和绝缘体通过绝缘的紧固件紧密连接；其中，导体用于沉积被测束流中被测粒子所带的电荷，绝缘体用于阻挡导体上产生的二次电子在相邻导体间扩散。上述多叶法拉第筒结构简单、占用空间小，其紧凑型结构可以将装置中的空气排出，较大幅度地降低多叶法拉第筒在大气环境下测量的本底噪声，提高了测试精确度和准确度。基于上述多叶法拉第筒，本公开的多叶法拉第筒测量系统能够在大气环境下实现对不同能量范围质子束流自动化测量，保证了测量过程的安全性，且操作方便快捷。