本发明提供一种基于多正电荷蛋白的纳米药物系统，包括纳米蛋白复合物与包裹在纳米蛋白复合物中药物；所述纳米蛋白复合物由多正电荷蛋白与带负电荷的聚合物表面活性剂形成。与现有技术相比，本发明提供的纳米药物系统直接以多正电荷蛋白为核心，将带有负电荷的聚合物表面活性剂及药物结合在多正电荷蛋白上，得到具有高生物相容性的纳米药物系统，用于肿瘤治疗尤其是用于骨癌及其转移癌的治疗可使药物在体内缓慢释放，延长药效，并显著减少副作用，具有较好的医学前景。