本发明提供一种基于深度学习和强化学习细胞病理图像辅助诊断系统，包括切边图像模块、深度学习模块、强化学习模块和辅助诊断模型模块；所述切边图像模块用于获取并分割全扫描细胞病理图像，确定分割图像；所述深度学习模块用于基于预设的深度学习检测算法，对所述分割图像进行训练处理，确定病变细胞的病变类别和相对位置；所述强化学习模块用于基于预设的强化学习算法，对所述分割图像进行分析处理，确定病变细胞的诊断阈值；其中，所述诊断阈值包括细胞分数阈值和诊断个数判别阈值；所述辅助诊断模型模块用于基于所述诊断阈值，按照所述病变细胞的病变类别和相对位置，生成辅助诊断模型。