本发明涉及轨道轨迹纠偏技术领域，特别涉及一种轨道交通工具运行轨迹定位监控方法及系统，包含：利用智能终端采集轨道交通工具GPS定位数据并建立该轨道交通工具运行状态模型；依据运行状态模型，并结合轨道线路标准轨迹、历史GPS定位数据进行纠偏，获取校准后的位置点；基于校准后位置点生成用于对轨道交通工具实施轨迹进行监控的最新轨迹数据。本发明利用智能终端采集轨道交通工具GPS定位数据，很好地解决基于非固定采集设备(即智能终端)环境下，对轨道交通工具运行轨迹的智能运算，无需增加专门的轨道交通工具定位设备，即可完成轨迹运算、监控，满足对轨道交通工具的实时监控需求，提升纠偏效率，具有较好的应用前景。