一种二类分割损失函数及其构建方法和应用，涉及深度学习与医学影像处理领域，解决了现有技术存在的背景不平衡、分割精度差的问题。本发明通过设定基础损失函数、设定适用于基础损失函数的限制项，设定平衡量，通过平衡量组合基础损失函数与限制项得到二类分割损失函数。本发明显著抑制了椎间盘组织图像分割时分割目标不平衡所带来的假阳性影响，提高了全卷积神经网络和二类分割损失函数的分割性能，提升了分割效果，在深度学习与医学影像处理技术领域具有极高的应用和推广价值。