本发明公开了一种快速建立覆盖层下底面三维模型的方法。它包括如下步骤：将风化残积型覆盖层概括为厚度控制型覆盖层，侵蚀堆积型覆盖层概括为高程控制型覆盖层；对于厚度控制型覆盖层，采用插值算法组合计算插值点的覆盖层厚度值，通过覆盖层上表面高程与插值点的覆盖层厚度值相减，即得到连续完整的覆盖层下底面高程数据；对于高程控制型覆盖层，采用单一插值算法对无控制点区域进行高程插值计算，直接获得连续完整的覆盖层下底面高程数据；最后将连续完整的下底面高程数据导入建模软件即可直接构建覆盖层下底面模型。本方法生成的覆盖层下底面无需进行变形操作，也无需大量的人工编辑操作，提高了覆盖层建模的精度与效率。