本发明公开了一种制备1,3‑二油酸‑2‑棕榈酸甘油三酯的方法，其包括，控制反应温度在饱和甘油三酯熔点以下，利用脂肪酶或者碱性催化剂催化棕榈硬脂进行酯交换反应，定向富集饱和甘油三酯，再通过油脂分提技术获得高熔点饱和甘油三酯，并以高油酸植物油脂肪酸为酰基供体，sn‑1,3位置选择性脂肪酶为催化剂，利用油酸取代饱和甘油三酯sn‑1,3位的棕榈酸，过滤或离心回收脂肪酶；利用熔点差异，分提去除一次酸解反应产物中的饱和脂肪酸及高熔点甘油三酯，并加入回收的脂肪酶继续进行二次酸解反应，最后，采用减压蒸馏脱除脂肪酸，获得富含1,3二油酸‑2棕榈酸甘油三酯的结构脂质产品。