公开了一种网络节点聚类方法、系统及计算机可读存储介质。一种方法可以包括：将第一网络的每个节点分配到不同节点集群，使得节点的数目等于节点集群的数目；选择第一网络的多个节点作为节点集合；以及选择多个节点集群作为节点集群集合。方法还可以包括：通过将节点集合中的一个或更多个节点重新分配到节点集群集合的不同节点集群，同时保持不属于节点集合的节点的已分配的节点集群，来求解第一优化问题；以及在将节点集合中的一个或更多个节点重新分配到不同节点集群之后，合并被分配到节点集群中的至少一个节点集群的节点，以形成具有与第一网络的节点的数目相比更少的节点的第二网络。