本发明提出一种发动机缸孔的变形分析方法、系统、存储介质及检测设备，该方法包括：建立与待测发动机机体中各个零件对应的零件三维实体模型；根据预设发动机安装需求将各个零件对应的三维实体模型进行装配，并根据发动机机体三维实体模型计算装配工况下缸孔在不同深度的轴向变形数据；计算热载荷下缸孔在不同深度的轴向变形数据；根据装配工况下以及热载荷下缸孔在不同深度的轴向变形数据获取缸孔变形梯度数据表，并根据预设缸孔标准指标对缸孔变形梯度数据表进行类比，以得到缸孔变形分析结果。本发明提出的发动机缸孔的变形分析方法，通过对缸孔的不同深度进行梯度分析，从而得到更加精确的缸孔变形分析结果。