本发明公开了一种皮肤镜图像分割方法与系统，包括：1)收集用于网络训练的皮肤镜图像作为训练样本，并进行预处理操作；2)对收集到的训练样本进行数据扩充操作；3)构建基于可变形卷积的注意力网络；4)训练基于可变形卷积的注意力网络；5)生成分割结果图。本发明基于可变形卷积的注意力网络进行皮肤镜图像的病灶区域分割，能够使用注意力机制抵抗图像中伪影干扰分割的同时尽可能保留更多病灶边缘的特征信息，缓解皮肤镜图像分割中分割蒙版边界模糊的问题，同时利用可变形卷积使特征提取适应病灶具有的不规则和尺度多变的特性，进一步可得到更加精确的分割结果图。