一种智能卡多功能测试方法及系统，包括读卡器和PC，所述读卡器具有接触界面和非接触界面，并设置有对应的接触端口和非接触端口，方法包括步骤1，当智能卡插入读卡器接触界面时，PC端自动选择接触端口，进入接触模式；当智能卡插入读卡器接触界面时，PC端通过指令设置接触界面为掉电状态，并使用指令选择非接触端口，从而在智能卡插入接触界面时进入非接触式模式；当智能卡在读卡器非接触界面时，PC端自动选择非接触端口，从而进入非接触式模式；步骤2，在接触模式或非接触模式下进行防拔测试、性能测试和跟踪测试。本发明集成非接和接触智能卡两种测试于一体，并能自动切换接触模式或非接触模式，完成种类较多的多样化测试，并且成本低廉。