公开了一种面向人机交互的船舶智能避碰方法及系统，该方法包括：获取目标船舶的基本尺度信息，并实现本船与目标船舶间间交换未来轨迹点或路径点；根据本船获取的目标船舶未来轨迹，排除能够导致船舶发生碰撞的航向与航速，并提供最优的避碰决策；将决策过程可视化，并允许船员设置优先决策区域，并在可行的决策区域中任意修改避碰决策；在避碰决策的可行解较少时，发出控制预警，提醒船员及时接管船舶；执行船舶安全的航向与航速，并允许船员随时直接接管控制船舶的螺旋桨转速与舵角。本发明能够将避碰决策过程以符合人机工程学的方式呈现给控制人员，帮助控制人员了解智能系统的操作意图，支持控制人员直接或间接地干预智能船舶的避让行动。