本申请适用于计算机应用技术领域，提供了一种水质等级预测方法、系统、终端设备及计算机可读存储介质，包括：根据目标水域的站点位置和各个站点关联的指标类型数据建立目标水域的站点检测图；基于异构图注意力网络对目标水域的站点检测图进行节点聚合，得到目标水域的站点检测图中每个节点的特征更新结果；根据目标水域的站点检测图中每个节点的特征更新结果生成目标水域的水域特征向量；根据历史检测数据和水域特征向量预测所述目标水域的水质等级，能够综合考虑多类型指标对水质情况的影响，又引入了历史水质特征对未来水质情况的影响，有效提高了水质等级预测的准确性，解决了目前对水质情况的预测准确性存在偏差的问题。