本发明涉及热试验数据处理领域，特别涉及一种基于热试验数据的反设计热模型修正系统及方法。其系统包括软件接口模块：提供热控分析软件自动运行的接口；卫星热模型：按照卫星已知输入条件和接触换热系数等待修正参数的假设值，在热控分析软件上建立卫星热分析模型；共轭梯度计算模块：根据热试验温度场与修正中卫星热模型计算的温度场，利用共轭梯度法逆计算待修正参数；软件接口模块接收计算得到的待修正参数数值，将其传递给热控分析软件，进行初始化并启动分析软件；获取热控分析软件计算的结果，将计算结果反馈给共轭梯度计算模块。在已知热平衡试验温度场的条件下，通过共轭梯度法逆设计热模型中的待修正参数，使得热模型仿真精度满足要求。