本发明涉及化学合成技术领域，尤其为一种高效制备新橙皮苷二氢查耳酮的方法，包括以下步骤：S1，将新橙皮苷充分溶解于氢氧化钠溶液中，质量体积为1:10～1:20；S2，在反应釜中加入催化剂，然后加入S1中溶解的新橙皮苷碱性溶液，密闭反应釜，用氮气置换反应釜中的空气，再用氢气置换反应釜内的氮气；S3，反应结束后，抽出反应液，过滤收集滤液，并回收催化剂，滤液使用盐酸调节PH，冷却至室温后冷藏结晶，结晶完成后过滤收集晶体，晶体使用其同等质量的冷水进行洗涤，洗出晶体表面的Cl^‑和Na⁺；S4，所得晶体为白色晶体，将其放入真空烘箱中进行干燥，收集晶体并粉碎成粉，本发明通过设计反应时间较短，能够有效的降低生产时候所需的时间成本。