本发明公开了一种样本制作仪的高低速控制方法及控制系统，包括：样本制作仪获取待染色件样本量与染色液种类；根据待染色件样本量与染色液种类确定染色模式，染色模式包括单染低速染色模式和单染高速染色模式；根据染色模式确定配液方式，当染色模式为单染高速染色模式时，包括通过至少两个染色液配液组件进行配液；根据配液方式对待染色件进行染色，当染色模式为单染高速染色模式时，包括通过至少一个稀释染色液染缸进行染色。本发明可以根据样本量多少以及染色液种类选择染色模式，使得染色具有多种染色组合模式，避免了资源浪费，且能够提高效率。