本实用新型公开了一种贝壳类海产品肉壳分离系统，包括多级分离子系统，每级分离子系统包括破碎装置、筛分装置、刮刀装置和盛放装置；破碎装置包括破碎箱、破碎组件和第一驱动机构，破碎箱设于水中，破碎组件设于破碎箱内；筛分装置包括筛网和第二驱动机构，筛网设于水中并位于出料口的下方；刮刀装置包括刮刀和第三驱动机构，刮刀设于水中并紧贴在筛网下表面；盛放装置包括盛放箱、可伸缩的挡板、第四驱动机构和第五驱动机构。本系统中的每级子系统破碎和筛分两大处理过程均是在水中进行处理的，由此可使得破碎后的肉与壳不会混在一起，便于分离处理，同时采用多级分离子系统进行一级一级的连续处理，有利于彻底分离肉壳，保证肉的完整性。