本发明涉及醋制备技术领域，公开了小分子果醋的制备方法，本发明通过设置四种原材料处理配比、进行搅拌、加水进行过滤提取、生物酶降解、保温进行发酵、固液分离、液体暂存、再次过滤、稀释暂存、进行浓缩、采用UF膜过滤组件进过滤和灌装这多个步骤，最终制得的小分子果醋相比于常规的醋，采用多次过滤的方式，并且在进行生产时利用UF膜对高分子物质进行过滤，最终得到的为小分子果醋，这种小分子果醋的味道和口感均比含有高分子化合物醋的口感和味道好，通过此种方法，达到了提高醋的口感和味道。主要是促进身体更充分吸收小分子果醋当中的营养元素。