本发明提供一种基于自主运行控制模式的列车筛选方法及系统，属于轨道交通领域，其中方法包括以下步骤：当前列车车载设备从道岔控制器获得计轴状态信息；当前列车车载设备从其他列车车载设备和道岔控制器，获得其他列车的位置信息；当前列车车载设备结合计轴状态信息和其他列车的位置信息完成对当前列车的筛选。本发明针对目前城市轨道交通列车筛选判断功能涉及设备环节多且信息传递判断速度慢，导致列车完成筛选后用于移动闭塞追踪的效率降低的问题，通过对功能进行重新分配，实现多种机制的组合，降低通信传输，提高车载设备自主判断控制能力，同时还能用于列车自主运行控制模式。