本发明公开了一种基于人工智能的药物靶点作用关系确定方法及装置，涉及智能医疗处理技术领域，主要目的在于解决现有无法准确对药物靶点的作用关系确认的问题。包括：获取目标药物的药物分子图像数据、以及蛋白质序列数据；从所述药物分子图像数据中提取分子结构表征信息，并从所述蛋白质序列数据中提取蛋白质靶点表征信息；从知识图谱中获取与所述分子结构表征信息和所述蛋白质靶点表征信息匹配的特征融合系数，并基于所述特征融合系数对所述分子结构表征信息、所述蛋白质靶点表征信息进行特征融合；基于已训练的双任务预测模型对特征融合后的所述分子结构表征信息、所述蛋白质靶点表征信息进行预测处理，得到的预测结果作为药物靶点作用关系。